RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 BRF1Q92994 677 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SHDQ96IW2 340 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 DIRC2Q96SL1 478 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PQH9 124 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 NOTOA8MTQ0 251 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PSPNO60542 156 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 TCF3P15923 654 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF124Q15973 351 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA32Q96LK8 384 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 H0Y8X5 98 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CBFA2T2O43439 604 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF445P59923 1031 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 MESP2Q0VG99 397 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2R5EQ16537 467 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 GP6Q9HCN6 339 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 KIR3DS1Q14943 382 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 OXR1Q8N573 874 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 CAPN10Q9HC96 672 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-206ENST00000467748 FITM1A5D6W6 292 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CD247P20963 164 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 DUSP4Q13115 394 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 GNPTABQ3T906 1256 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SHISA4Q96DD7 197 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP6Q96JE9 813 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR160Q9UJ42 338 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF205O95201 554 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 VAV1P15498 845 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 BMP8BP34820 402 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 NR0B2Q15466 257 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 RTP2Q5QGT7 225 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FGD4Q96M96 766 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 HAUS7Q99871 368 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CHRNEQ04844 493 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 LILRA2Q8N149 483 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FIBCD1Q8N539 461 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 EPHX1P07099 455 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 GSTM1P09488 218 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC7A5Q01650 507 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2R5DQ14738 602 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 KSR1Q8IVT5 923 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 PRR13Q9NZ81 148 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 GSNP06396 782 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ITGA4P13612 1032 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 IFNGR1P15260 489 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SDHBP21912 280 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CASP7P55210 303 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC14A2Q15849 920 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRX1Q86UT6 975 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms