RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CEP95Q96GE4 821 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 GMLQ99445 158 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 EYA3Q99504 573 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 MFRPQ9BY79 579 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 KAT14Q9H8E8 782 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 ESYT2A0FGR8 921 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 YDJCA8MPS7 323 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 EDIL3O43854 480 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 BMP15O95972 392 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 TSPY8P0CW00 308 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 NLRP12P59046 1061 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 IL17AQ16552 155 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 LONRF3Q496Y0 759 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT17Q6IS24 598 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 MED15Q96RN5 788 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD1Q99460 953 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 SWAP70Q9UH65 585 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.46□□□□□ -1.37
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PTPRC-210ENST00000462363 USP17L5A8MUK1 530 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FOXN1O15353 648 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ENTPD3O75355 529 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SLURP2P0DP57 97 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SCNN1DP51172 638 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF543Q08ER8 600 aa6.46□□□□□ -1.38
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