RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 USP49Q70CQ1 688 aa16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 LAMB1P07942 1786 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 A0A087X0B3 334 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 H7C1D1 291 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 MAP2K7O14733 419 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 CHMP4BP1P59074 171 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 GALNT17Q6IS24 598 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 SLC51AQ86UW1 340 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 A0A1W2PQC6 194 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 CTAGE9A4FU28 777 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 TEX33O43247 280 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 KIF5BP33176 963 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PPP1R2P41236 205 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 GRAPQ13588 217 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 KCNB1Q14721 858 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 ANKS1AQ92625 1134 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 SHISA4Q96DD7 197 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 EPSTI1Q96J88 318 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 FUT8Q9BYC5 575 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 LAD1O00515 517 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 SCG2P13521 617 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PDE6BP35913 854 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PAK1Q13153 545 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PTGDRQ13258 359 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 IQCDQ96DY2 449 aa16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TTLL1-203ENST00000439248 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SNAP23O00161 211 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 GYPCP04921 128 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SRGNP10124 158 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 AFMP43652 599 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 GNAQP50148 359 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 EXOC4Q96A65 974 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CUEDC2Q9H467 287 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SLX4Q8IY92 1834 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 XDHP47989 1333 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 MCM3P25205 808 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 YY1P25490 414 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 KRT31Q15323 416 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 HDXQ7Z353 690 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 N4BP3O15049 544 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CHRNA5P30532 468 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CASP14P31944 242 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CTR9Q6PD62 1173 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC82Q8N4S0 544 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 THAP9Q9H5L6 903 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 PLEKHA8P1O95397 391 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 NPR1P16066 1061 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ATP2B1P20020 1258 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 PRPHP41219 470 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms