RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC12A2P55011 1212 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX22Q9Y458 520 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D8O95759 1140 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GNGT1P63211 74 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GRM1Q13255 1194 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP44Q17R89 818 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC89Q8N998 374 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAS4Q8TDM0 211 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO1AQ9UBC5 1043 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TCP1P17987 556 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R5CQ13362 524 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 LONRF2Q1L5Z9 754 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 UFL1O94874 794 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MGARPQ8TDB4 240 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 LPIN2Q92539 896 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 HAUS4Q9H6D7 363 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP56O00567 594 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE8AO60658 829 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCY2FP51841 1108 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SATB1Q01826 763 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SH2D4BQ5SQS7 431 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TSC1Q92574 1164 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 HYOU1Q9Y4L1 999 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN7Q9Y6W3 813 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 DNM2P50570 870 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 BLZF1Q9H2G9 400 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CHL1O00533 1208 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 IRX4P78413 519 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 IP6K1Q92551 441 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 DESI2Q9BSY9 194 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RIC8AQ9NPQ8 531 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 STK38LQ9Y2H1 464 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NSMFQ6X4W1 530 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CNBD1Q8NA66 436 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NOD1Q9Y239 953 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GNA14O95837 355 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KA2Q15349 733 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF14Q5TI25 921 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CPXCR1Q8N123 301 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP5Q96PP8 586 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 IWS1Q96ST2 819 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNG1Q9UIX4 513 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK3O14649 394 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PFKFB1P16118 471 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCB4P21439 1286 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP4P98171 946 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 LRMPQ12912 555 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PNOCQ13519 176 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 BSPRYQ5W0U4 402 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NSMCE1Q8WV22 266 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL3Q9Y4R7 772 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KRIT1O00522 736 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RDH13Q8NBN7 331 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 USP28Q96RU2 1077 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MAST3O60307 1309 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 E7EWF7 191 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CFBP00751 764 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXC9P31274 260 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TFAP4Q01664 338 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 DSCC1Q9BVC3 393 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR70Q9NW82 654 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNI1P19237 187 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS41P49754 854 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ME3Q16798 604 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MUM1Q2TAK8 710 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MED4Q9NPJ6 270 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms