RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 NMT2O60551 498 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 PBX1P40424 430 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 CNKSR1Q969H4 720 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 WNT7AO00755 349 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 CYP2D6P10635 497 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 AFMP43652 599 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 LTBP1Q14766 1721 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 TTLL6Q8N841 843 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 SNED1Q8TER0 1413 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 ITIH6Q6UXX5 1313 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 TFAP4Q01664 338 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 SPAG1Q07617 926 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 PNMA1Q8ND90 353 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 CCDC51Q96ER9 411 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 MYL1P05976 194 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 PIM2Q9P1W9 311 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 XDHP47989 1333 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 M0R2N6 131 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 LAD1O00515 517 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 TXLNAP40222 546 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 USP5P45974 858 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 DNAI1Q9UI46 699 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 USP17L8P0C7I0 530 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 GPSM2P81274 684 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 SP8Q8IXZ3 490 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 TPM1P09493 284 aa26.9■■□□□ 1.9
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PMS1-205ENST00000409985 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 C21orf2O43822 256 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 FECHP22830 423 aa26.89■■□□□ 1.9
PMS1-205ENST00000409985 SMARCA1P28370 1054 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 EVX2Q03828 476 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 PRPHP41219 470 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 CBX1P83916 185 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 ELF2Q15723 593 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 IL17AQ16552 155 aa26.88■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 FAM53CQ9NYF3 392 aa26.88■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 ADKP55263 362 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 TRIM14Q14142 442 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.86■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.85■■□□□ 1.89
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PMS1-205ENST00000409985 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 CUEDC2Q9H467 287 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 BCS1LQ9Y276 419 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 CASQ1P31415 396 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K9P80192 1104 aa26.84■■□□□ 1.89
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