RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA0754	O94854	1291 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	INPP5B	P32019	993 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	KCNB1	Q14721	858 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	RREB1	Q92766	1687 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	EXOC5	O00471	708 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TACC1	O75410	805 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ZBED6	P86452	979 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	KAT14	Q9H8E8	782 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	XDH	P47989	1333 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	AGPS	O00116	658 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PSMA7	O14818	248 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	HSF2BP	O75031	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PDE8B	O95263	885 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	IDE	P14735	1019 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CCT5	P48643	541 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TDO2	P48775	406 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	VAV2	P52735	878 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	HERVK_113	P62684	666 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	LPIN2	Q92539	896 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ESR2	Q92731	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	GGA2	Q9UJY4	613 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	MBD4	O95243	580 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	SRGN	P10124	158 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	SPA17	Q15506	151 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CHP1	Q99653	195 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	SNX12	Q9UMY4	172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	DDAH1	O94760	285 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ABL1	P00519	1130 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ITGA6	P23229	1130 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	GNGT1	P63211	74 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CHRNA2	Q15822	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPARG-208	ENST00000397023	TOMM22	Q9NS69	142 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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