RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364207.1

RNU6-188P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 188, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-188P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-188P-201ENST00000364207 ST7Q9NRC1 585 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-188P-201ENST00000364207 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-188P-201ENST00000364207 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-188P-201ENST00000364207 CBFA2T2O43439 604 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PRAMEF1O95521 474 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 BMP8BP34820 402 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 GRB10Q13322 594 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SERINC3Q13530 473 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 FIBCD1Q8N539 461 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 BVESQ8NE79 360 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 TCTN2Q96GX1 697 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SGSM3Q96HU1 749 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZFP64Q9NPA5 681 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SHOXO15266 292 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF445P59923 1031 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 AMPD2Q01433 879 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZP2Q05996 745 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 EGR3Q06889 387 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 DUSP4Q13115 394 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 GAB4Q2WGN9 574 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 MTERF2Q49AM1 385 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ARTNQ5T4W7 220 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 FGD4Q96M96 766 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 AKT3Q9Y243 479 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 U3KQE9 123 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SHISA3A0PJX4 238 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 B2RBV5 119 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CD8BP10966 210 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PLCL1Q15111 1095 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 NBPF11Q86T75 865 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 BRF1Q92994 677 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CCDC140Q96MF4 163 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 LNPKQ9C0E8 428 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 TCFL5Q9UL49 500 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 MEIS1O00470 390 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 MED26O95402 600 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SYPP08247 313 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 FUT4P22083 530 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 BNIP3Q12983 259 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PPP2R5DQ14738 602 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 DPH6Q7L8W6 267 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ADCY4Q8NFM4 1077 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SNTG2Q9NY99 539 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 H0Y8X5 98 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF205O95201 554 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CPP00450 1065 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 ESR1P03372 595 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 RAC2P15153 192 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 VAV1P15498 845 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CHRNEQ04844 493 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 RASA3Q14644 834 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 KSR1Q8IVT5 923 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 OXR1Q8N573 874 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 NAT16Q8N8M0 369 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-188P-201ENST00000364207 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms