RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB11Q8WXH4 323 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2FQ969M7 185 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC7Q99615 494 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP13Q9UII6 198 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKT3Q9Y243 479 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 H0Y8X5 98 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGAVP06756 1048 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSTR4P31391 388 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD97P48960 835 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCQQ04759 706 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRB10Q13322 594 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 IKZF1Q13422 519 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAB4Q2WGN9 574 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREG2Q8IUH2 290 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCTN2Q96GX1 697 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGSM3Q96HU1 749 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAV3Q9UKW4 847 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM23O75077 832 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNH1O95259 989 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD3EP07766 207 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYPP08247 313 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSKP43235 329 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP2R2AP63151 447 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMPD2Q01433 879 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 POU4F1Q01851 419 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGR4Q9BXB1 951 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCFL5Q9UL49 500 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PQU0 124 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASH4PA8MWX3 477 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 STXBP3O00186 592 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX1O43435 398 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKTNO75072 461 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRNPP04156 253 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPINK2P20155 84 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP8BP34820 402 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD96P40200 585 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGR3Q06889 387 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2orf27AQ580R0 203 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 DTX1Q86Y01 620 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLCNQ8NFG4 579 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCY3O60266 1144 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF205O95201 554 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED26O95402 600 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESR1P03372 595 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAV1P15498 845 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOP2P46087 812 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 BNIP3Q12983 259 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 LILRB2Q8N423 598 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-78P-201ENST00000362897 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms