RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361987.5

CNTF-201, Transcript of ciliary neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNTF, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTF-201ENST00000361987 CPVLQ9H3G5 476 aa14.68□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 VWA5AO00534 786 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 PEX10O60683 326 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 KIF5BP33176 963 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GRM4Q14833 912 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ANKRD1Q15327 319 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 PLA2G6O60733 806 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 MAP3K14Q99558 947 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.67□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 MYPNQ86TC9 1320 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 SNAP25P60880 206 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 PLS1Q14651 629 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 C17orf99Q6UX52 265 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 LBX2Q6XYB7 198 aa14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ZBED4O75132 1171 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 EVCP57679 992 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 STK3Q13188 491 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 RTN1Q16799 776 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 CPXCR1Q8N123 301 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 MB21D1Q8N884 522 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 GPR25O00155 361 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 SLC4A3P48751 1232 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 Q3C1V9 767 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 NBPF11Q86T75 865 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 BTBD7Q9P203 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTF-201ENST00000361987 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 FOXN1O15353 648 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ST18O60284 1047 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 BCRP11274 1271 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 GNAQP50148 359 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 RCAN1P53805 252 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ERVK-9P63128 1117 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ERVK-24P63145 666 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CCDC174Q6PII3 467 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CNMDO75829 334 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 FDX1P10109 184 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CDC27P30260 824 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 SP3Q02447 781 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CYTH3O43739 400 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 STAT3P40763 770 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 PPP2R5BQ15173 497 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 RLFQ13129 1914 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 CCNA1P78396 465 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ME3Q16798 604 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 HOMER1Q86YM7 354 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTF-201ENST00000361987 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms