RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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PMS1-201ENST00000342075 LDHDQ86WU2 507 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 DCAF4Q8WV16 495 aa16.05■□□□□ 0.16
PMS1-201ENST00000342075 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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PMS1-201ENST00000342075 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.02■□□□□ 0.16
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PMS1-201ENST00000342075 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 24.4
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PMS1-201ENST00000342075 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-201ENST00000342075 CPXCR1Q8N123 301 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-201ENST00000342075 ATG4CQ96DT6 458 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-201ENST00000342075 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-201ENST00000342075 GBP4Q96PP9 640 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-201ENST00000342075 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.97■□□□□ 0.15
PMS1-201ENST00000342075 SMARCA1P28370 1054 aa15.97■□□□□ 0.15
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