RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ZMYND10O75800 440 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CAGE1Q8TC20 777 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GSDMAQ96QA5 445 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CTAGE9A4FU28 777 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GYPCP04921 128 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1B0GTH6 734 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 E2F4Q16254 413 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GRIK5Q16478 980 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 DYMQ7RTS9 669 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TECP42680 631 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 FUT8Q9BYC5 575 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MFAP3LO75121 409 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TXKP42681 527 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 IL17AQ16552 155 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC6O95255 1503 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 SRGAP2O75044 1071 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CNGA4Q8IV77 575 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 B4DLN1 442 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 NFIXQ14938 502 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 SOGA3Q5TF21 947 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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SPNS2-201ENST00000329078 RIMBP2O15034 1052 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CYP27A1Q02318 531 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 FUT2Q10981 343 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 STIM1Q13586 685 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CNPY4Q8N129 248 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MTRQ99707 1265 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ATRNO75882 1429 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 C6orf229H3BNL8 230 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 BMP15O95972 392 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 KLK7P49862 253 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 PDE4DQ08499 809 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 PNKPQ96T60 521 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 RFC4P35249 363 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 KLRF2D3W0D1 207 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GLI3P10071 1580 aa22.28■■□□□ 1.16
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SPNS2-201ENST00000329078 GJA10Q969M2 543 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 DDAH1O94760 285 aa22.27■■□□□ 1.16
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SPNS2-201ENST00000329078 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.27■■□□□ 1.16
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SPNS2-201ENST00000329078 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 ERVK-24P63145 666 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-201ENST00000329078 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 CALML3P27482 149 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
SPNS2-201ENST00000329078 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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