RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TANGO6Q9C0B7 1094 aa31.71■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3D19Q5HYK7 790 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTNL9Q6UXG8 535 aa31.7■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP31.64■■■□□ 2.66
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO28Q9NVF7 368 aa31.64■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-201ENST00000318988 USP17L15C9J2P7 530 aa31.63■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP17L13C9JLJ4 530 aa31.63■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 hCG_1984214I3L0E3 225 aa31.63■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP17L24Q0WX57 530 aa31.63■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BRMS1Q9HCU9 246 aa31.6■■■□□ 2.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ14Q9UNX9 436 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC9Q9Y397 364 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM88BA6NKF7 163 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 FDX1P10109 184 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 CETPP11597 493 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.656e-11■□□□□ 10.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 COG2Q14746 738 aa31.59■■■□□ 2.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPRYD7Q5W111 196 aa31.59■■■□□ 2.65
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