RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		7.16	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	RAD17	O75943	681 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	LBX1	P52954	281 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	CXCL9	Q07325	125 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	DLK2	Q6UY11	383 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
MFSD8-240	ENST00000641658	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MYH3	P11055	1940 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CHL1	O00533	1208 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PLAUR	Q03405	335 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TCIRG1	Q13488	830 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	RALBP1	Q15311	655 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CST9	Q5W186	159 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM89A	Q96GI7	184 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.15	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	RASSF10	A6NK89	507 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	YDJC	A8MPS7	323 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SOX18	P35713	384 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PSMD2	Q13200	908 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	AOC2	O75106	756 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	HYAL2	Q12891	473 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GRAP	Q13588	217 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	RUNDC1	Q96C34	613 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CAPNS2	Q96L46	248 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	PSME4	Q14997	1843 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	SIN3B	O75182	1162 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	BBOX1	O75936	387 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	EDN3	P14138	238 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	GNA15	P30679	374 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	NRL	P54845	237 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DAB2	P98082	770 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	IRF7	Q92985	503 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MFSD8-240	ENST00000641658		J3QW42	95 aa		7.12	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms