RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494		U3KQE9	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEACAM5	P06731	702 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPHX1	P07099	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	OXCT1	P55809	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	BRF1	Q92994	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q96M66	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494		H3BS24	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUSD5	O60279	629 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAT2	P11245	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOSL1	P15407	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRIK1	P39086	918 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNK2	Q07912	1038 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SERINC3	Q13530	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	APBA2	Q99767	749 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIF1	Q9H611	641 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGRP	O00253	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDPK1	O15530	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPM1B	O75688	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITGA4	P13612	1032 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD247	P20963	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SSTR4	P31391	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SHOX	O15266	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF445	P59923	1031 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	AOC3	Q16853	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	WHRN	Q9P202	907 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-222	ENST00000588494	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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