RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.01■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 VCPKMTQ9H867 229 aa23.01■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 GOPCQ9HD26 462 aa23.01■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.01■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 RLFQ13129 1914 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 RAD21O60216 631 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 GJB1P08034 283 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 CCL5P13501 91 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 GJA8P48165 433 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 NOVP48745 357 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 KRT32Q14532 448 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 CCDC178Q5BJE1 867 aa23■■□□□ 1.27
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SPHK1-204ENST00000587167 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 CHST3Q7LGC8 479 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 UBAC1Q9BSL1 405 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 PNMA3Q9UL41 463 aa23■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 FLT3LGP49771 235 aa22.99■■□□□ 1.27
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SPHK1-204ENST00000587167 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 TTC14Q96N46 770 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 NEK1Q96PY6 1258 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 TNKSO95271 1327 aa22.99■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 ADCY3O60266 1144 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 VCAM1P19320 739 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 UBXN2AP68543 259 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 LPAR1Q92633 364 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.98■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 F5H6K3 240 aa22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 MCM5P33992 734 aa22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 ANTXR2P58335 489 aa22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 KLRC3Q07444 240 aa22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 DGKHQ86XP1 1220 aa22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 RNF208Q9H0X6 261 aa22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-204ENST00000587167 ERICH2A1L162 156 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 USP17L15C9J2P7 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.95■■□□□ 1.26
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SPHK1-204ENST00000587167 USP17L18D6R9N7 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 USP17L22D6RA61 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 USP17L19D6RCP7 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 USP17L20D6RJB6 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 PRC1O43663 620 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 NDUFB10O96000 172 aa22.95■■□□□ 1.26
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SPHK1-204ENST00000587167 USP17L24Q0WX57 530 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 SEC23AQ15436 765 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 SLFN13Q68D06 897 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 ANKS1AQ92625 1134 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 MTMR7Q9Y216 660 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 PLXNB2O15031 1838 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 ELNP15502 786 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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SPHK1-204ENST00000587167 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 KAT14Q9H8E8 782 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 INHAP05111 366 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 WTAPQ15007 396 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 COA7Q96BR5 231 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 MYH6P13533 1939 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 H0YGN5 161 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 SGPL1O95470 568 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 CPA1P15085 419 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-204ENST00000587167 PSMA5P28066 241 aa22.92■■□□□ 1.26
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