RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 RARBP10826 455 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 TLE2Q04725 743 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 PGK2P07205 417 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 KCTD2Q14681 263 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 PHF24Q9UPV7 400 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 ADD2P35612 726 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 CDK8P49336 464 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 C12orf60Q5U649 245 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 RNF180Q86T96 592 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 TINF2Q9BSI4 451 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-208ENST00000553786 SMIM22K7EJ46 135 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 RAD21O60216 631 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 HMMRO75330 724 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 PGK1P00558 417 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 CLTBP09497 229 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 MYLIPQ8WY64 445 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 GOPCQ9HD26 462 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 EYSQ5T1H1 3165 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 USP17L12C9JPN9 530 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 USP17L21D6R901 530 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 MYH8P13535 1937 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 VCANP13611 3396 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 A0A1W2PQY0 241 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 VWA5AO00534 786 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 AKR1A1P14550 325 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 RAG1P15918 1043 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ITGB8P26012 769 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 COPB2P35606 906 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 STAT3P40763 770 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 FOSL2P15408 326 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 PARP14Q460N5 1801 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 KIAA0355O15063 1070 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 RAB11FIP3O75154 756 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ATP5JP18859 108 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 EPHB4P54760 987 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 FPGSQ05932 587 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 HAUS7Q99871 368 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 CDH23Q9H251 3354 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 CHGBP05060 677 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 MS4A1P11836 297 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 UBE3CQ15386 1083 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 REPS2Q8NFH8 660 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 TTC28Q96AY4 2481 aa20.14■□□□□ 0.82
PRRX1-208ENST00000553786 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ADAMTS4O75173 837 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 CTR9Q6PD62 1173 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ACLYP53396 1101 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms