RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546590.2

TMTC2-202, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMTC2, Length 4,527 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2-202ENST00000546590 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 KCTD1Q719H9 257 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 KCNJ18B7U540 433 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CLCN6P51797 869 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CHMP4BP1P59074 171 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SP4Q02446 784 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 MORC3Q14149 939 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 KCNJ12Q14500 433 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 LLGL1Q15334 1064 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 UBE2SQ16763 222 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 NBPF11Q86T75 865 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SLC35F6Q8N357 371 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RGS22Q8NE09 1264 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CTAGE8P0CG41 777 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 PIGSQ96S52 555 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TRIM10Q9UDY6 481 aa9.5□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TRAF5O00463 557 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 WNT7AO00755 349 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 PTPREP23469 700 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 LIFRP42702 1097 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 VSTM4Q8IW00 320 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CCDC42Q96M95 316 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TMEM260Q9NX78 707 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 PPP6R2O75170 966 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 LDHCP07864 332 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SORBS3O60504 671 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CYP4A11Q02928 519 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CABP7Q86V35 215 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 GOLGA1Q92805 767 aa9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 BUB1O43683 1085 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 PLCD1P51178 756 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ERLIN1O75477 346 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CALML3P27482 149 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RDH13Q8NBN7 331 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 VEZTQ9HBM0 779 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 C6orf50Q9HD87 102 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 USP21Q9UK80 565 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 IFT81Q8WYA0 676 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ZBTB22O15209 634 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CAMTA2O94983 1202 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 BCS1LQ9Y276 419 aa9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 POTEMA6NI47 508 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 MEIS1O00470 390 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SYCP1Q15431 976 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 NYXQ9GZU5 481 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 GGA1Q9UJY5 639 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SAMM50Q9Y512 469 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TRIM37O94972 964 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 SLFN14P0C7P3 912 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 ST5P78524 1137 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.47□□□□□ -0.89
TMTC2-202ENST00000546590 PTPAQ15257 358 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms