RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNAI2	P04899	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	SHMT1	P34896	483 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	PBX2	P40425	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	APBB1	O00213	710 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZAP70	P43403	619 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ELP1	O95163	1332 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1W2PRG0	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	PGK2	P07205	417 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSF2RA	P15509	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	COPB2	P35606	906 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLCD1	P51178	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNA10	Q16322	511 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	BMP1	P13497	986 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	FGB	P02675	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ACR	P10323	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	STAT3	P40763	770 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARVCF	O00192	962 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDK7	P50613	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	GABPA	Q06546	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABCB7	O75027	752 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ICA1	Q05084	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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