RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MOCS3	O95396	460 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MCAM	P43121	646 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	IRAK1	P51617	712 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NCK2	O43639	380 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	POTED	Q86YR6	584 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	EXOC5	O00471	708 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K14	Q99558	947 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEA1	P43355	309 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXO4	P98177	505 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	ESR2	Q92731	530 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PHKG2	P15735	406 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	GUCY1A3	Q02108	690 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PDE4D	Q08499	809 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NNT	Q13423	1086 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT14	P02533	472 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	LY9	Q9HBG7	655 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF18	P17022	549 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	KLK7	P49862	253 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	GREM2	Q9H772	168 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	MYBL2	P10244	700 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNAR1	P17181	557 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	ADD2	P35612	726 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC24C	P53992	1094 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ERCC3-208	ENST00000491292	TNKS	O95271	1327 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC5A1	P13866	664 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM14	Q14142	442 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.96	□□□□□ -0.66
ERCC3-208	ENST00000491292	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.66

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