RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 TOMM22Q9NS69 142 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.8■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa28.8■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.8■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.8■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 CHMLP26374 656 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 ATG4CQ96DT6 458 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 INCENPQ9NQS7 918 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 STRNO43815 780 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 CAPN2P17655 700 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 RGS2P41220 211 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 NOVP48745 357 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 HAND2P61296 217 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 MORN1Q5T089 497 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 STX8Q9UNK0 236 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.78■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 USP6NLQ92738 828 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 MROH8Q9H579 483 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 FEM1BQ9UK73 627 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 CENPFP49454 3210 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD1-211ENST00000489379 POTEFA5A3E0 1075 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 SLC25A27O95847 323 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 HMGCRP04035 888 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ELNP15502 786 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 PTPREP23469 700 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 COPB2P35606 906 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 SLFN13Q68D06 897 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ESR2Q92731 530 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 GMCL1Q96IK5 515 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 VWA5AO00534 786 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 INHAP05111 366 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 FDX1P10109 184 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 MAP2K5Q13163 448 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 WDR78Q5VTH9 848 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 TTC14Q96N46 770 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 NBPF3Q9H094 633 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.75■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 BMP3P12645 472 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CCL5P13501 91 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CYP2B6P20813 491 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 PLS1Q14651 629 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 APBA2Q99767 749 aa28.74■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 GJB1P08034 283 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 GRB14Q14449 540 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 MTFR1Q15390 333 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ABRAQ8N0Z2 381 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 RNF208Q9H0X6 261 aa28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 PLA2G6O60733 806 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ERCC3P19447 782 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 FAM160B2Q86V87 743 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.72■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 SGSM2O43147 1006 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 NMT2O60551 498 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 HOXC6P09630 235 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 TOP1P11387 765 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 STAT3P40763 770 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 SLC1A4P43007 532 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 IL25Q9H293 177 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 SLC5A4Q9NY91 659 aa28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
EHD1-211ENST00000489379 ATP2A1O14983 1001 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 ZBED4O75132 1171 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 RCSD1Q6JBY9 416 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 IQCA1Q86XH1 822 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 REPS2Q8NFH8 660 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 KRT23Q9C075 422 aa28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 GJA8P48165 433 aa28.69■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 STAT2P52630 851 aa28.69■■■□□ 2.18
EHD1-211ENST00000489379 DCAF4Q8WV16 495 aa28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms