RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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SENP6-210ENST00000487548 FAM221AA4D161 298 aa5.67□□□□□ -1.5
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SENP6-210ENST00000487548 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 ABLIM1O14639 778 aa5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 PRAMEF1O95521 474 aa5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 PRKCAP17252 672 aa5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 RTP5Q14D33 572 aa5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 ARSHQ5FYA8 562 aa5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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