RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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USP11-208ENST00000480104 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.83□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 HIPK3Q9H422 1215 aa14.83□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ABCF2Q9UG63 623 aa14.83□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.83□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ACACBO00763 2458 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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USP11-208ENST00000480104 SEMA3EO15041 775 aa14.82□□□□□ -0.04
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USP11-208ENST00000480104 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ZNF384Q8TF68 577 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ZNF536O15090 1300 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 SIPA1L1O43166 1804 aa14.82□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 VWCEQ96DN2 955 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 GINM1Q9NU53 330 aa14.81□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 CD4P01730 458 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 MECOMQ03112 1051 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ZP2Q05996 745 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 TTLL4Q14679 1199 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 APAF1O14727 1248 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 GH2P01242 217 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ASGR1P07306 291 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 TEX11Q8IYF3 940 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 PRRX2Q99811 253 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 TINF2Q9BSI4 451 aa14.79□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ALDH1L1O75891 902 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 RASGRF1Q13972 1273 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ATP2B3Q16720 1220 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.78□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 ZNF292O60281 2723 aa14.77□□□□□ -0.04
USP11-208ENST00000480104 PGK2P07205 417 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ID4P47928 161 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 USP14P54578 494 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ACER1Q8TDN7 264 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SCLYQ96I15 445 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MROH8Q9H579 483 aa14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 EYA2O00167 538 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 FCER1AP12319 257 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PLS1Q14651 629 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.76□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 RGS20O76081 388 aa14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ADORA1P30542 326 aa14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 IRS1P35568 1242 aa14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.75□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SLC9A7Q96T83 725 aa14.75□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 CCDC102BQ68D86 513 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 NEK9Q8TD19 979 aa14.74□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.74□□□□□ -0.05
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