RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 COPB2P35606 906 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 ESR2Q92731 530 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 TTC14Q96N46 770 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.77■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.77■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 RAD21O60216 631 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ADCY3O60266 1144 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 FEM1BQ9UK73 627 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 STX8Q9UNK0 236 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A27O95847 323 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 NDUFB10O96000 172 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 NOVP48745 357 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 Q3C1V9 767 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 GPR142Q7Z601 462 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 IQCA1Q86XH1 822 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 GMCL1Q96IK5 515 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 KRT23Q9C075 422 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 MROH8Q9H579 483 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 GJD2Q9UKL4 321 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 GABRQQ9UN88 632 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SGSM2O43147 1006 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PLA2G6O60733 806 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 CNMDO75829 334 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 RGS2P41220 211 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 HAND2P61296 217 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 CASC1Q6TDU7 716 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 BTBD7Q9P203 1132 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 VWA5AO00534 786 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 BMP3P12645 472 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLC1A4P43007 532 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 TRDNQ13061 729 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLFN13Q68D06 897 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 FAM160B2Q86V87 743 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 DGKHQ86XP1 1220 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PORCNQ9H237 461 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ATP2A1O14983 1001 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ZBED4O75132 1171 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 HMGCRP04035 888 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 STAT2P52630 851 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 OAZ1P54368 228 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 MAP2K5Q13163 448 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 MORN1Q5T089 497 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 WDR78Q5VTH9 848 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ATG4CQ96DT6 458 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 APBA2Q99767 749 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PLXNB2O15031 1838 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 HOXC6P09630 235 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PTPREP23469 700 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 STAT3P40763 770 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 GRB14Q14449 540 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PLS1Q14651 629 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 DCAF4Q8WV16 495 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 USP6NLQ92738 828 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 INCENPQ9NQS7 918 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 PNMA2Q9UL42 364 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-211ENST00000476336 GJB1P08034 283 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 FCER1AP12319 257 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ERCC3P19447 782 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MTFR1Q15390 333 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MAP4K1Q92918 833 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 NBPF3Q9H094 633 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms