RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 FGFR1P11362 822 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 GLB1P16278 677 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 L1CAMP32004 1257 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 BVESQ8NE79 360 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 NACC1Q96RE7 527 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 GP6Q9HCN6 339 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf172C9J069 976 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPNS1P04632 268 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP7Q14244 749 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM209AQ5JX71 171 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL18Q96ME1 805 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR13Q9NZ81 148 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087WZG4 1122 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NFICP08651 508 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SGO2Q562F6 1265 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH24Q86UP0 819 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PRODHO43272 600 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 APBA3O96018 575 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ITGB2P05107 769 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NOS3P29474 1203 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 STAT3P40763 770 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NSMFQ6X4W1 530 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 RIN3Q8TB24 985 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MYRFLQ96LU7 910 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 LGR4Q9BXB1 951 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 AKT3Q9Y243 479 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MSTNO14793 375 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TBX1O43435 398 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 RAPGEF3O95398 923 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP7A1P22680 504 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIA2P42262 883 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF445P59923 1031 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GRB10Q13322 594 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 OSBP2Q969R2 916 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 IER2Q9BTL4 223 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 LGR6Q9HBX8 967 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087X0B3 334 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE8AO60658 829 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 RXRBP28702 533 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CNGA1P29973 690 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX5P35711 763 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRE1Q14246 886 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms