RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469303.1

SRSF10-208, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, human

TSL 3

Gene SRSF10, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF10-208	ENST00000469303	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67	2e-8	■□□□□ 10.8
SRSF10-208	ENST00000469303	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	NACAD	O15069	1562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303		H0Y8X5	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	ITGAV	P06756	1048 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRSF10-208	ENST00000469303	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303		A0A1W2PQU0	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	BLACE	A4D250	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ADCY3	O60266	1144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	L1CAM	P32004	1257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CCNF	P41002	786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CYP26A1	O43174	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ETV3	P41162	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	NCAPH	Q15003	741 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	ARNTL	O00327	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	KCNH1	O95259	989 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CEACAM5	P06731	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	IFNGR1	P15260	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	MKL1	Q969V6	931 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	APBA2	Q99767	749 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SRSF10-208	ENST00000469303	FKTN	O75072	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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