RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PNMA3Q9UL41 463 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGEF1-206ENST00000461017 MYH6P13533 1939 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 MYPNQ86TC9 1320 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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RABGEF1-206ENST00000461017 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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RABGEF1-206ENST00000461017 USP14P54578 494 aa8.34□□□□□ -1.07
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RABGEF1-206ENST00000461017 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.34□□□□□ -1.07
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RABGEF1-206ENST00000461017 METRNQ9UJH8 293 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.34□□□□□ -1.07
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RABGEF1-206ENST00000461017 ALPK3Q96L96 1907 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 F5H6K3 240 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB10O96000 172 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 ELNP15502 786 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 NOVP48745 357 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRC3Q07444 240 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 COG2Q14746 738 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.33□□□□□ -1.08
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZMYM6O95789 1325 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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RABGEF1-206ENST00000461017 TSPY8P0CW00 308 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGEF1-206ENST00000461017 HIP1O00291 1037 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 SGSM2O43147 1006 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGEF1-206ENST00000461017 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPK3Q9Y572 518 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 B4E1Z4 1266 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 POTEB2H3BUK9 544 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA5AO00534 786 aa8.3□□□□□ -1.08
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