RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 SLFN13Q68D06 897 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 31.1
ODC1-202ENST00000405333 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 NDUFB10O96000 172 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ASNSP08243 561 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SCG2P13521 617 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 TRIM29Q14134 588 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 HOMER1Q86YM7 354 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SLC1A4P43007 532 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SULF1Q8IWU6 871 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 WRNIP1Q96S55 665 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS3O15072 1205 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 FIBPO43427 364 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 MMP1P03956 469 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 POTEIP0CG38 1075 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 POTEJP0CG39 1038 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 DCAF15Q66K64 600 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 OXER1Q8TDS5 423 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PIGSQ96S52 555 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 TMX2Q9Y320 296 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 DOCK1Q14185 1865 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 WDR90Q96KV7 1748 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 BTBD18B2RXH4 712 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 DGKZQ13574 1117 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 USP48Q86UV5 1035 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 NR5A1Q13285 461 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 NPY5RQ15761 445 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 DCAF4Q8WV16 495 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 KLRG1Q96E93 195 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 USP17L10C9JJH3 530 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 GMCL1Q96IK5 515 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 SMARCA1P28370 1054 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 HOOK2Q96ED9 719 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 SNAP25P60880 206 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 RGS22Q8NE09 1264 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 USP28Q96RU2 1077 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 OTOFQ9HC10 1997 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 TMEM232C9JQI7 657 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 STXBP3O00186 592 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 BMP3P12645 472 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 XBP1P17861 261 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 KRT85P78386 507 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 VCPKMTQ9H867 229 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 GOPCQ9HD26 462 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 FAM205CA6NFA0 338 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 CDCA5Q96FF9 252 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms