RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TREML4Q6UXN2 200 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NSMFQ6X4W1 530 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CDH24Q86UP0 819 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TOP6BLQ8N6T0 577 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ADCY4Q8NFM4 1077 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MYRFLQ96LU7 910 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCNF1Q9H3M0 494 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SEMA6CQ9H3T2 930 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LGR6Q9HBX8 967 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GP6Q9HCN6 339 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRR13Q9NZ81 148 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DHX15O43143 795 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RAB11FIP3O75154 756 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SLITRK5O94991 958 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCNH1O95259 989 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 VIL1P09327 827 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BMP3P12645 472 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CPEP16870 476 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NOS3P29474 1203 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 L1CAMP32004 1257 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCNJ6P48051 423 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AMPD2Q01433 879 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CDK5R2Q13319 367 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GRB10Q13322 594 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TM4SF20Q53R12 229 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SGO2Q562F6 1265 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM209AQ5JX71 171 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FIBCD1Q8N539 461 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 WFDC12Q8WWY7 111 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCTD13Q8WZ19 329 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EXOC2Q96KP1 924 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FBXL18Q96ME1 805 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCDC140Q96MF4 163 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZDHHC15Q96MV8 337 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CEP89Q96ST8 783 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IER2Q9BTL4 223 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MCM8Q9UJA3 840 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EMC9Q9Y3B6 208 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRBA1A5PL33 1030 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GNAT3A8MTJ3 354 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SHOXO15266 292 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PDE8AO60658 829 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 EFCAB14O75071 495 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 RAPGEF3O95398 923 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ITIH2P19823 946 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FLT3P36888 993 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 STAT3P40763 770 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KIR3DL1P43629 444 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF445P59923 1031 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GABREP78334 506 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MAP4K2Q12851 820 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MBTPS1Q14703 1052 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPP2R5DQ14738 602 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SFRP5Q5T4F7 317 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LCE2CQ5TA81 110 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BEND4Q6ZU67 534 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TXNRD3Q86VQ6 643 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM20CQ8IXL6 584 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BRF1Q92994 677 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.8 ms