RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 ERICH2A1L162 156 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CUTAO60888 179 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CASP1P29466 404 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CAVIN4Q5BKX8 364 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 USP49Q70CQ1 688 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TEX33O43247 280 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MMP14P50281 582 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 RTN1Q16799 776 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 BTBD18B2RXH4 712 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 LIG3P49916 1009 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 STX17P56962 302 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 SERTAD1Q9UHV2 236 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TM4SF1P30408 202 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 FAM47AQ5JRC9 791 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 ABL1P00519 1130 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 VSNL1P62760 191 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MECOMQ03112 1051 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CASP8Q14790 479 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TMTC2Q8N394 836 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MMP1P03956 469 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MNAT1P51948 309 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 PRR5LQ6MZQ0 368 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 PROM2Q8N271 834 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 L1RE1Q9UN81 338 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 RTL9Q8NET4 1388 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 F8W031 263 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 BANK1Q8NDB2 785 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CXorf56Q9H5V9 222 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 RIMBP2O15034 1052 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 SLURP2P0DP57 97 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 PPARAQ07869 468 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MCTP2Q6DN12 878 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 NID2Q14112 1375 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 ERLIN1O75477 346 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 POSTNQ15063 836 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC91Q7Z6B0 441 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MTA3Q9BTC8 594 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 MXD3Q9BW11 206 aa17.15■□□□□ 0.34
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L12C9JPN9 530 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 USP17L21D6R901 530 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 STX10O60499 249 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 GYS1P13807 737 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 NR5A1Q13285 461 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 FAM212AQ96EL1 285 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 DOCK2Q92608 1830 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 DEXIO95424 95 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 FBXW10Q5XX13 1052 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 FANCBQ8NB91 859 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 DDR1Q08345 913 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 KAT2BQ92831 832 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 TIAM2Q8IVF5 1701 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF18P17022 549 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED1-201ENST00000381218 DYNLL2Q96FJ2 89 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms