RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 SMARCA1P28370 1054 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 WDR18Q9BV38 432 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 VCPKMTQ9H867 229 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 VGLL4Q14135 290 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 MAP3K11Q16584 847 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 TRAF5O00463 557 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ALG1Q9BT22 464 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 H3BQV1 296 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 PKP1Q13835 747 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 IFFO2Q5TF58 517 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 CHADLQ6NUI6 762 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 KCTD1Q719H9 257 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 C8orf76Q96K31 380 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 USP17L10C9JJH3 530 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 BRD1O95696 1058 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 BMP3P12645 472 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 USP14P54578 494 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 RGS22Q8NE09 1264 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 LPAR1Q92633 364 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.9■■□□□ 1.1
PRRT1-202ENST00000375150 FKBP1BP68106 108 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 SPP2Q13103 211 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 MTMR2Q13614 643 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM29Q14134 588 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 MTMR6Q9Y217 621 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 UNCXA6NJT0 531 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 CYTH3O43739 400 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 XBP1P17861 261 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 FOSBP53539 338 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 SCG2P13521 617 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 BACE1P56817 501 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 MOB2Q70IA6 237 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 AIFM3Q96NN9 605 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 CPVLQ9H3G5 476 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM75PA6NK02 468 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 C19orf81C9J6K1 198 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 PKN1Q16512 942 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM232C9JQI7 657 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 ERO1BQ86YB8 467 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 ELP3Q9H9T3 547 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 SLC16A2P36021 539 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 STAT2P52630 851 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 PPATQ06203 517 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 GUCY1B3Q02153 619 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 HOMER1Q86YM7 354 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT1-202ENST00000375150 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms