RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 F5H6K3 240 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2MP0CAP2 368 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TOP1P11387 765 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ACTN1P12814 892 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SYN1P17600 705 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 KLRF2D3W0D1 207 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NR1I2O75469 434 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-201ENST00000348564 UBE3CQ15386 1083 aa5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-201ENST00000348564 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC148Q8NFR7 591 aa5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-201ENST00000348564 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AMNQ9BXJ7 453 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ACAD9Q9H845 621 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GPR108Q9NPR9 543 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-201ENST00000348564 MSRAQ9UJ68 235 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A27O95847 323 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1B1P15121 316 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 KCNA3P22001 575 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TMOD1P28289 359 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL4Q14679 1199 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MYOCDQ8IZQ8 938 aa5.08□□□□□ -1.6
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