RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 DDIT3P35638 169 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 NBPF11Q86T75 865 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 STK36Q9NRP7 1315 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 PPFIA3O75145 1194 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 USP14P54578 494 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 FUT2Q10981 343 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 SPP2Q13103 211 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CCDC71L-201ENST00000315965 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 BMP3P12645 472 aa27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SMARCA1P28370 1054 aa27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 MYH6P13533 1939 aa27.89■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 PDCP20941 246 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 BACE1P56817 501 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 MTMR2Q13614 643 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 KCTD1Q719H9 257 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 ERO1BQ86YB8 467 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 LPAR1Q92633 364 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 ELP3Q9H9T3 547 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.88■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.87■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIM75PA6NK02 468 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 C19orf81C9J6K1 198 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 PPATQ06203 517 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 WASF1Q92558 559 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SPDYE5A6NIY4 337 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 DEXIO95424 95 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 YY1P25490 414 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CYTH3O43739 400 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 WDR46O15213 610 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SYT1P21579 422 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CST9Q5W186 159 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 OTUD5Q96G74 571 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 CPVLQ9H3G5 476 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 EMILIN3Q9NT22 766 aa27.83■■■□□ 2.05
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM232C9JQI7 657 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 NUCB2P80303 420 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 C12orf42Q96LP6 360 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 ALG1Q9BT22 464 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 PASKQ96RG2 1323 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 PPIL2Q13356 520 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 OPTNQ96CV9 577 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.82■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 CXCL11O14625 94 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 STX6O43752 255 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 TOMM70O94826 608 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC16A2P36021 539 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 STAT2P52630 851 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 HMGCS2P54868 508 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 BTNL9Q6UXG8 535 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 PTPRFP10586 1907 aa27.81■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 PLA2G6O60733 806 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 VCAM1P19320 739 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 PKN1Q16512 942 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 CHURC1Q8WUH1 139 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 C8orf76Q96K31 380 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CCDC71L-201ENST00000315965 FEM1BQ9UK73 627 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms