RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 CCDC96Q2M329 555 aa29.18■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 CCDC82Q8N4S0 544 aa29.18■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 PHKBQ93100 1093 aa29.18■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 DDX11Q96FC9 970 aa29.18■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 MTMR2Q13614 643 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 KLRF2D3W0D1 207 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 FUT2Q10981 343 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 MYH6P13533 1939 aa29.17■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 UNCXA6NJT0 531 aa29.16■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 TRIM75PA6NK02 468 aa29.16■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 CST9Q5W186 159 aa29.16■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.16■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.16■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 BACE1P56817 501 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 KCTD1Q719H9 257 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 NBPF11Q86T75 865 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 ERO1BQ86YB8 467 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 USP14P54578 494 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 SLC26A6Q9BXS9 759 aa29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 BMP3P12645 472 aa29.14■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.14■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 LPAR1Q92633 364 aa29.14■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa29.14■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 PTPRFP10586 1907 aa29.14■■■□□ 2.26
NTN3-201ENST00000293973 PASKQ96RG2 1323 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 PPATQ06203 517 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 OTUD5Q96G74 571 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 STK36Q9NRP7 1315 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 TOMM70O94826 608 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 FDPSP14324 419 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 DDIT3P35638 169 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 CPVLQ9H3G5 476 aa29.13■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 C19orf81C9J6K1 198 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 CYTH3O43739 400 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 DGKZQ13574 1117 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 KIF3AQ9Y496 699 aa29.12■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 SMARCA1P28370 1054 aa29.11■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.11■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 OPTNQ96CV9 577 aa29.11■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.11■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 HMGCS2P54868 508 aa29.1■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 IRF6O14896 467 aa29.1■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 PPIL2Q13356 520 aa29.1■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 V9GY48 417 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 SLC16A2P36021 539 aa29.09■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 C12orf42Q96LP6 360 aa29.09■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 TMEM232C9JQI7 657 aa29.08■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 DEXIO95424 95 aa29.08■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 VCAM1P19320 739 aa29.08■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.08■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.08■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
NTN3-201ENST00000293973 PDCP20941 246 aa29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 STAT2P52630 851 aa29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.07■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 CXCL11O14625 94 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 WASF1Q92558 559 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 SYT1P21579 422 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 HUNKP57058 714 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 BTNL9Q6UXG8 535 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 AIFM3Q96NN9 605 aa29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 GJA5P36382 358 aa29.05■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 PKN1Q16512 942 aa29.05■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 ALG1Q9BT22 464 aa29.05■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NTN3-201ENST00000293973 FEM1BQ9UK73 627 aa29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms