RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFA10O95299 355 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 IVLP07476 585 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP27A1Q02318 531 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 TICAM2Q86XR7 235 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.91■■□□□ 1.42
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCA3Q99758 1704 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTSWP56202 376 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 HERVK_113P62684 666 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 C2orf54Q08AI8 447 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPEF2Q9C093 1822 aa23.91■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.422e-6■■■□□ 18
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CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 HPCAL4Q9UM19 191 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.9■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 PP2D1A8MPX8 630 aa23.89■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT2P35908 639 aa23.89■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRCPP42785 496 aa23.89■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP14P54578 494 aa23.89■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT23Q9C075 422 aa23.89■■□□□ 1.42
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYH7P12883 1935 aa23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 NMT2O60551 498 aa23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLRP10Q86W26 655 aa23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAGE1Q8TC20 777 aa23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.89■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERCC3P19447 782 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNQ4P56696 695 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAK1Q13153 545 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 GSDMAQ96QA5 445 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 EHD2Q9NZN4 543 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.88■■□□□ 1.41
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CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC38Q5R3I4 469 aa23.88■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.88■■□□□ 1.41
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CSNK1G2-201ENST00000255641 E2F4Q16254 413 aa23.87■■□□□ 1.41
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CSNK1G2-201ENST00000255641 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.87■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCC12Q96J65 1359 aa23.87■■□□□ 1.41
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CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR59Q6PJI9 974 aa23.87■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.87■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.87■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.87■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 STIM1Q13586 685 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAGEA9P43362 315 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCT5P48643 541 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC7A5Q01650 507 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.86■■□□□ 1.41
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CSNK1G2-201ENST00000255641 KAT14Q9H8E8 782 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.86■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 EP400Q96L91 3159 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 B4DLN1 442 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 AGPSO00116 658 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIG3P49916 1009 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTMR7Q9Y216 660 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATRNO75882 1429 aa23.85■■□□□ 1.41
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALX1Q15699 326 aa23.84■■□□□ 1.41
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