RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.02■■□□□ 1.6
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HTATSF1-201ENST00000218364 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1-201ENST00000218364 STAMQ92783 540 aa25.01■■□□□ 1.59
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1-201ENST00000218364 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.01■■□□□ 1.59
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HTATSF1-201ENST00000218364 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS16Q9H269 839 aa24.99■■□□□ 1.59
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HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ12Q14500 433 aa24.99■■□□□ 1.59
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HTATSF1-201ENST00000218364 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.94■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFA10O95299 355 aa24.94■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC20A2Q08357 652 aa24.93■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADSSL1Q8N142 457 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF384Q8TF68 577 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC7Q99615 494 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 GDAQ9Y2T3 454 aa24.93■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE4AQ14139 1066 aa24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.92■■□□□ 1.58
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