RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A087X0B3 334 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 N4BP3O15049 544 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 AFMP43652 599 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 STX17P56962 302 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT31Q15323 416 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 OXER1Q8TDS5 423 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A0U1RQJ8 604 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 PSMD14O00487 310 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATA5Q8NB90 893 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 FGFR2P21802 821 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 C10orf67Q8IYJ2 551 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 EPSTI1Q96J88 318 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 INCENPQ9NQS7 918 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC102AQ96A19 550 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 RMND1Q9NWS8 449 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 TDO2P48775 406 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 LAMB2P55268 1798 aa25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGEA9P43362 315 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 USP14P54578 494 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 VGLL3A8MV65 326 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC5A1P13866 664 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 PAK1Q13153 545 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 SEMA3FQ13275 785 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP2B1P20020 1258 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ARMT1Q9H993 441 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 NDUFA10O95299 355 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT9P35527 623 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNQ4P56696 695 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 E2F4Q16254 413 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 USP21Q9UK80 565 aa25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1W2PQC6 194 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM66O15016 1216 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAPPC10P48553 1259 aa25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNJ18B7U540 433 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNJ12Q14500 433 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 SEC23AQ15436 765 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 ESR2Q92731 530 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 H7C1D1 291 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 PKN1Q16512 942 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 TOMM22Q9NS69 142 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 XDHP47989 1333 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 CALM1P0DP23 149 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 CALM2P0DP24 149 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 CALM3P0DP25 149 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC7Q99615 494 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54-201ENST00000215941 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms