RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 FEZ1Q99689 392 aa15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NID2Q14112 1375 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZBTB43O43298 467 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ECE1P42892 770 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 USP14P54578 494 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TROAPQ12815 778 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SPP2Q13103 211 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PPIL2Q13356 520 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 HSCBQ8IWL3 235 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 OPTNQ96CV9 577 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MAP3K14Q99558 947 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GOPCQ9HD26 462 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 C19orf81C9J6K1 198 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 USP17L10C9JJH3 530 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 BACE1P56817 501 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MTMR2Q13614 643 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MICU3Q86XE3 530 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LPAR1Q92633 364 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 OTUD5Q96G74 571 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GMCL1Q96IK5 515 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 VCPKMTQ9H867 229 aa15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM75PA6NK02 468 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 F5H6K3 240 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CXCL11O14625 94 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PFKFB2O60825 505 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NDUFB10O96000 172 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SNHG28P0DPA3 235 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PDHBP11177 359 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KLRC3Q07444 240 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GRM4Q14833 912 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP2R5BQ15173 497 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ME3Q16798 604 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SLFN13Q68D06 897 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 DCAF4Q8WV16 495 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 WNK4Q96J92 1243 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 C12orf42Q96LP6 360 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MYL10Q9BUA6 226 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 IRF6O14896 467 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LARGE1O95461 756 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KIF5BP33176 963 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 APLP1P51693 650 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 BECN1Q14457 450 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RTN1Q16799 776 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RGMBQ6NW40 437 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FANCBQ8NB91 859 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TMX3Q96JJ7 454 aa15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RXRAP19793 462 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GJA5P36382 358 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC1A4P43007 532 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GNAQP50148 359 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SPRYD7Q5W111 196 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GTF3C6Q969F1 213 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CREBZFQ9NS37 354 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MTMR7Q9Y216 660 aa15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RAD21O60216 631 aa15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms