RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 LRP2BPQ9P2M1 347 aa3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 APEX2Q9UBZ4 518 aa3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXL21Q9UKT6 434 aa3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 MINPP1Q9UNW1 487 aa3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ENPP3O14638 875 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 TBX1O43435 398 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ADCY3O60266 1144 aa3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 CDC45O75419 566 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 CLSTN1O94985 981 aa3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 ITGAVP06756 1048 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 CD247P20963 164 aa3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 MBTPS1Q14703 1052 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP2R5DQ14738 602 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 C2orf27AQ580R0 203 aa3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 JMYQ8N9B5 988 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ADCY4Q8NFM4 1077 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.25□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 HAUS7Q99871 368 aa3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa3.25□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.24□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.24□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM214BQ7L5A3 538 aa3.24□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.24□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 HOMER1Q86YM7 354 aa3.24□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.24□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.24□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 KLHL25Q9H0H3 589 aa3.24□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 CHRNA4P43681 627 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF445P59923 1031 aa3.23□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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SPTAN1-232ENST00000636483 BEND4Q6ZU67 534 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 CD163Q86VB7 1156 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM20CQ8IXL6 584 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXL6Q8N531 539 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 BVESQ8NE79 360 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 Q96M66 194 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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