RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.06■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UNCXA6NJT0 531 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AOC2O75106 756 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSPA6P17066 643 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RXRAP19793 462 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NT5C2P49902 561 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APOBRQ0VD83 1088 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC96Q2M329 555 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PNMA1Q8ND90 353 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPNS2Q96L46 248 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR18Q9BV38 432 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOPCQ9HD26 462 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR19Q8NEZ3 1342 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AK2P54819 239 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNAPC2Q13487 334 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RABEP1Q15276 862 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMX2Q9Y320 296 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RASSF10A6NK89 507 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDUFB10O96000 172 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BACE1P56817 501 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCL15Q16663 113 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLFN13Q68D06 897 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CATIPQ7Z7H3 387 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MICU3Q86XE3 530 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DGKHQ86XP1 1220 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC102AQ96A19 550 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VCPKMTQ9H867 229 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 F5H6K3 240 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GTF2A2P52657 109 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP14P54578 494 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLRC3Q07444 240 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STK3Q13188 491 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HHIPL1Q96JK4 782 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTC14Q96N46 770 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZIC5Q96T25 663 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VCAM1P19320 739 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TREML2Q5T2D2 321 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCTD1Q719H9 257 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL17RAQ96F46 866 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPCPD1Q9NPB8 672 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C19orf81C9J6K1 198 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CXCL11O14625 94 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ST18O60284 1047 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CETPP11597 493 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LIFRP42702 1097 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC1A4P43007 532 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VEGFBP49765 207 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APOA5Q6Q788 366 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRI3BPQ8WY22 251 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MKL1Q969V6 931 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PARP14Q460N5 1801 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB43O43298 467 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDHBP11177 359 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOVP48745 357 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKS1AQ92625 1134 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTA3Q9BTC8 594 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDAH1O94760 285 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LARGE1O95461 756 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BMP3P12645 472 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms