RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR25O00155 361 aa13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PTH1RQ03431 593 aa13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ICA1Q05084 483 aa13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 FEZ1Q99689 392 aa13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.44□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PLIN4Q96Q06 1357 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF213O14771 459 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ORC4O43929 436 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TLR2O60603 784 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP2C8P10632 490 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM47AQ5JRC9 791 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C12orf42Q96LP6 360 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 MYH4Q9Y623 1939 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.43□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 CDC45O75419 566 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPY3P0CV98 308 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPY8P0CW00 308 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 USP14P54578 494 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TFAP4Q01664 338 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 CEP95Q96GE4 821 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TMX2Q9Y320 296 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 MAP4K1Q92918 833 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.42□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NEDD4P46934 1319 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPY2A6NKD2 308 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 FKTNO75072 461 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 VCAM1P19320 739 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP2B2Q01814 1243 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C17orf99Q6UX52 265 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 VCPKMTQ9H867 229 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TOMM22Q9NS69 142 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NYAP2Q9P242 653 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 CPA4Q9UI42 421 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PNMA3Q9UL41 463 aa13.41□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NMT2O60551 498 aa13.4□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP21A2P08686 494 aa13.4□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 SP3Q02447 781 aa13.4□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 SH2D4AQ9H788 454 aa13.4□□□□□ -0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 PARP14Q460N5 1801 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 RLFQ13129 1914 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TTLL1O95922 423 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 BCRP11274 1271 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 OSBPP22059 807 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CAP1Q01518 475 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 IFFO2Q5TF58 517 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CASC1Q6TDU7 716 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 LPAR1Q92633 364 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 MKL1Q969V6 931 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.39□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L15C9J2P7 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L13C9JLJ4 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L11C9JVI0 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L18D6R9N7 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L22D6RA61 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L17D6RBQ6 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L19D6RCP7 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L20D6RJB6 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 NOVP48745 357 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L24Q0WX57 530 aa13.38□□□□□ -0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms