RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 TMX2Q9Y320 296 aa26.94■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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CLN3-232ENST00000568443 RGS2P41220 211 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 TRIM32Q13049 653 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 SBK1Q52WX2 424 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 MORN1Q5T089 497 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 WDR78Q5VTH9 848 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 TRIB2Q92519 343 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 LPAR1Q92633 364 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 USP6NLQ92738 828 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 BTBD7Q9P203 1132 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 GPAA1O43292 621 aa26.92■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 ATP2B2Q01814 1243 aa26.92■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.92■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.92■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 APPP05067 770 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 GNAT2P19087 354 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 MX1P20591 662 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 CEP290O15078 2479 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.9■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 FSD1Q9BTV5 496 aa26.9■■□□□ 1.9
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CLN3-232ENST00000568443 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.9■■□□□ 1.9
CLN3-232ENST00000568443 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.9■■□□□ 1.9
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CLN3-232ENST00000568443 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.89■■□□□ 1.9
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CLN3-232ENST00000568443 SLC15A5A6NIM6 579 aa26.88■■□□□ 1.89
CLN3-232ENST00000568443 FLOT1O75955 427 aa26.88■■□□□ 1.89
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CLN3-232ENST00000568443 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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CLN3-232ENST00000568443 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa26.87■■□□□ 1.89
CLN3-232ENST00000568443 MB21D1Q8N884 522 aa26.87■■□□□ 1.89
CLN3-232ENST00000568443 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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CLN3-232ENST00000568443 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.86■■□□□ 1.89
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CLN3-232ENST00000568443 PLS1Q14651 629 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN3-232ENST00000568443 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.84■■□□□ 1.89
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CLN3-232ENST00000568443 STRNO43815 780 aa26.82■■□□□ 1.88
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CLN3-232ENST00000568443 STAP2Q9UGK3 403 aa26.82■■□□□ 1.88
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CLN3-232ENST00000568443 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 PDE1AP54750 535 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 NCAPG2Q86XI2 1143 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 NBPF3Q9H094 633 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 NAPBQ9H115 298 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 MROH8Q9H579 483 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 PRDM1O75626 825 aa26.79■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.79■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.79■■□□□ 1.88
CLN3-232ENST00000568443 EVI5LQ96CN4 794 aa26.79■■□□□ 1.88
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