RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SCG2	P13521	617 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	KIF5B	P33176	963 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PTGDR	Q13258	359 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF174	Q15697	407 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB22	O15209	634 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF3	O75054	1194 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS2	O95450	1211 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CALML3	P27482	149 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CASQ1	P31415	396 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN21	Q16825	1174 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		20.91	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP5	P59047	1200 aa		20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NPHP1	O15259	732 aa		20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	GNG11	P61952	73 aa		20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	20.9	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	KIF20A	O95235	890 aa		20.89	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC175	P0C221	793 aa		20.89	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		20.89	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP3	Q96P20	1036 aa		20.89	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	20.89	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		20.89	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		20.89	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	20.89	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		20.89	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		20.89	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	LAMB1	P07942	1786 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TADA3	O75528	432 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC51	Q96ER9	411 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TAF1	P21675	1872 aa		20.88	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TSPY2	A6NKD2	308 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	PBX1	P40424	430 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K9	P80192	1104 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	E2F4	Q16254	413 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	RMND1	Q9NWS8	449 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CASZ1	Q86V15	1759 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	WNT7A	O00755	349 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TXLNA	P40222	546 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG1	Q07617	926 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CNGA4	Q8IV77	575 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		20.87	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	FANCG	O15287	622 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CARD6	Q9BX69	1037 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TEX33	O43247	280 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	KCNQ2	O43526	872 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN6	P51797	869 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	STX17	P56962	302 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	DGKH	Q86XP1	1220 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	SETDB2	Q96T68	719 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	KAT14	Q9H8E8	782 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		20.86	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	NMT2	O60551	498 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	GNAQ	P50148	359 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	FAM193A	P78312	1265 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	WDR24	Q96S15	920 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	NARF	Q9UHQ1	456 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	XDH	P47989	1333 aa		20.85	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	RBL2	Q08999	1139 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MFAP3L	O75121	409 aa		20.84	■□□□□ 0.93

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