RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PSMA5P28066 241 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DGKZQ13574 1117 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IFNL1Q8IU54 200 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KCNB2Q92953 911 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MKL1Q969V6 931 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTC14Q96N46 770 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VCPKMTQ9H867 229 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTMR7Q9Y216 660 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNKSO95271 1327 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 F5H6K3 240 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PDHXO00330 501 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRPA1O75762 1119 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ALDH1A1P00352 501 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FGD1P98174 961 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KLRC3Q07444 240 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MOGSQ13724 837 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WTAPQ15007 396 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TREML2Q5T2D2 321 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DGKHQ86XP1 1220 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LPAR1Q92633 364 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C12orf42Q96LP6 360 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPN18Q99952 460 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KAT14Q9H8E8 782 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L15C9J2P7 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L11C9JVI0 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L18D6R9N7 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L22D6RA61 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L19D6RCP7 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L20D6RJB6 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NDUFB10O96000 172 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CPA1P15085 419 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VCAM1P19320 739 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OSBPP22059 807 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANTXR2P58335 489 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANAPC15P60006 121 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP17L24Q0WX57 530 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SEC23AQ15436 765 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLFN13Q68D06 897 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMTC2Q8N394 836 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 JMYQ8N9B5 988 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PNMA1Q8ND90 353 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKS1AQ92625 1134 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM87BQ96K49 555 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTA3Q9BTC8 594 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BACH2Q9BYV9 841 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RNF186Q9NXI6 227 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PNMA3Q9UL41 463 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.25□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC69A6NI79 296 aa8.24□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CA12O43570 354 aa8.24□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BMP3P12645 472 aa8.24□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPS6KB1P23443 525 aa8.24□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC1A4P43007 532 aa8.24□□□□□ -1.09
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NOVP48745 357 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms