RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 CYP21A2P08686 494 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CTGFP29279 349 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SP3Q02447 781 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RASGRP2Q7LDG7 609 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 VCPKMTQ9H867 229 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 KANSL2Q9H9L4 492 aa10.21□□□□□ -0.77
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CS-211ENST00000548041 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PNMA3Q9UL41 463 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 B4E1Z4 1266 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 LCTP09848 1927 aa10.2□□□□□ -0.78
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CS-211ENST00000548041 OSBPP22059 807 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 HERVK_113P62684 666 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 FRMPD3Q5JV73 1810 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 MAP4K1Q92918 833 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 SH2D4AQ9H788 454 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 NYAP2Q9P242 653 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L15C9J2P7 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L11C9JVI0 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L18D6R9N7 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L22D6RA61 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L19D6RCP7 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L20D6RJB6 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 KDM4AO75164 1064 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TTLL1O95922 423 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 USP17L24Q0WX57 530 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 FAM83BQ5T0W9 1011 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 GOPCQ9HD26 462 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 STX8Q9UNK0 236 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 F5H6K3 240 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CNMDO75829 334 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 NDUFB10O96000 172 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 KLRC3Q07444 240 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CASC1Q6TDU7 716 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 LPAR1Q92633 364 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ESR2Q92731 530 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ERO1AQ96HE7 468 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 MTMR7Q9Y216 660 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TRIM17Q9Y577 477 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 MCM3APO60318 1980 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 E7EWF7 191 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 SLC27A2O14975 620 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 FLOT1O75955 427 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 NOVP48745 357 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 RCSD1Q6JBY9 416 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TNS4Q8IZW8 715 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 MKL1Q969V6 931 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ATG4CQ96DT6 458 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TRIM47Q96LD4 638 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 BTBD7Q9P203 1132 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 TNKSO95271 1327 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 PSMC4P43686 418 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ERVK-9P63128 1117 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-211ENST00000548041 ERVK-24P63145 666 aa10.16□□□□□ -0.78
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