RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 OTOFQ9HC10 1997 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 FAM196BA6NMK8 535 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 USP17L5A8MUK1 530 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 FGAP02671 866 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MCCP23508 829 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 INPP5BP32019 993 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MAP2K2P36507 400 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CDK8P49336 464 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 GTF2A2P52657 109 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PPATQ06203 517 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 GABPAQ06546 454 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SNAPC2Q13487 334 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 E2F4Q16254 413 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 VPS53Q5VIR6 699 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MOB2Q70IA6 237 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SKAP1Q86WV1 359 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 FEZ1Q99689 392 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SH2D4AQ9H788 454 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ELP3Q9H9T3 547 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SIPA1L1O43166 1804 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 LAMA4Q16363 1823 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TSPY2A6NKD2 308 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 C19orf81C9J6K1 198 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CXCL11O14625 94 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 GDF11O95390 407 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 GH2P01242 217 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TSPY3P0CV98 308 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TSPY8P0CW00 308 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CYP2D6P10635 497 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CETPP11597 493 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PTPRAP18433 802 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PRSS12P56730 875 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PPIL2Q13356 520 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 LAPTM4AQ15012 233 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SPRYD7Q5W111 196 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 IQCA1Q86XH1 822 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ESR2Q92731 530 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 MAP4K1Q92918 833 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 WNK4Q96J92 1243 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 KRT23Q9C075 422 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 WDR70Q9NW82 654 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 TSKSQ9UJT2 592 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 FZD1Q9UP38 647 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ERICH2A1L162 156 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 USP17L10C9JJH3 530 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CA12O43570 354 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ORC4O43929 436 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ALDH1A1P00352 501 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 RASA1P20936 1047 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SHMT1P34896 483 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 VEGFBP49765 207 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 USP14P54578 494 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 HAND2P61296 217 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 HTRA3P83110 453 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 ICA1Q05084 483 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 KRT32Q14532 448 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 WDR18Q9BV38 432 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-210ENST00000547912 DNAJC18Q9H819 358 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms