RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	NKD1	Q969G9	470 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	LEFTY1	O75610	366 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SLITRK5	O94991	958 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM253	P0C7T8	217 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	MED14OS	P0DP75	135 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	PAK2	Q13177	524 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	MLEC	Q14165	292 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	EOMES	O95936	686 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	FYB2	Q5VWT5	728 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	IMPDH2	P12268	514 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SOX9	P48436	509 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	CLC	Q05315	142 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	GMIP	Q9P107	970 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	GGN	Q86UU5	652 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LGR5-204	ENST00000547310	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	DNAJA2	O60884	412 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CEACAM5	P06731	702 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	SYN1	P17600	705 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	MCM4	P33991	863 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CCNF	P41002	786 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	OXCT1	P55809	520 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	MIPEP	Q99797	713 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310		U3KQE9	123 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CYP7A1	P22680	504 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	GLDC	P23378	1020 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	ETV3	P41162	512 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	KIRREL1	Q96J84	757 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	RGS13	O14921	159 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	KIR3DL1	P43629	444 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	ATG4C	Q96DT6	458 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
LGR5-204	ENST00000547310	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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