RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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PTPRJ-206ENST00000534219 SBK1Q52WX2 424 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRJ-206ENST00000534219 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRJ-206ENST00000534219 LBX2Q6XYB7 198 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRJ-206ENST00000534219 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.88■■■□□ 2.37
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PTPRJ-206ENST00000534219 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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PTPRJ-206ENST00000534219 NR2E3Q9Y5X4 410 aa29.74■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.73■■■□□ 2.35
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PTPRJ-206ENST00000534219 MROH8Q9H579 483 aa29.73■■■□□ 2.35
PTPRJ-206ENST00000534219 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.73■■■□□ 2.35
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