RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 SBK1Q52WX2 424 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 C12orf60Q5U649 245 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 C19orf81C9J6K1 198 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 EVI5O60447 810 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 TTC6Q86TZ1 520 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 EHD4Q9H223 541 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 ERVK-9P63128 1117 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 ERVK-24P63145 666 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 ALX1Q15699 326 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 PORCNQ9H237 461 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 GINM1Q9NU53 330 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 APPP05067 770 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 SGSM2O43147 1006 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 FGAP02671 866 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 SHMT1P34896 483 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 RPTORQ8N122 1335 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 PRO3102Q9H379 93 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.14■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 RAD50Q92878 1312 aa22.14■■□□□ 1.14
PUF60-218ENST00000531995 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 VCAM1P19320 739 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MAPK4P31152 587 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 TDO2P48775 406 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CCL14Q16627 93 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 Q3C1V9 767 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 GPR142Q7Z601 462 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ACER1Q8TDN7 264 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 PTH1RQ03431 593 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 C12orf42Q96LP6 360 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 NAPBQ9H115 298 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CNMDO75829 334 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 WDR78Q5VTH9 848 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 APBA2Q99767 749 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CDC45O75419 566 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 RGS2P41220 211 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CDK8P49336 464 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 PARP14Q460N5 1801 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 ZMYM6O95789 1325 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L15C9J2P7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L11C9JVI0 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L18D6R9N7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L22D6RA61 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L19D6RCP7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L20D6RJB6 530 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 GUCY1A2P33402 732 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP14P54578 494 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 PPARAQ07869 468 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-218ENST00000531995 USP17L24Q0WX57 530 aa22.1■■□□□ 1.13
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