RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SPRED2	Q7Z698	418 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047		Q96M66	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	UBOX5	O94941	541 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ZP2	Q05996	745 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ABI1	Q8IZP0	508 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	CD96	P40200	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	LRRN2	O75325	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	BIN1	O00499	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SRF	P11831	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	LTK	P29376	864 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	GIPR	P48546	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-208	ENST00000504047	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ACR	P10323	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ARID5A	Q03989	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	EGR3	Q06889	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SHD	Q96IW2	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ESR1	P03372	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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