RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468672.5

TRAF3IP3-208, Transcript of TRAF3 interacting protein 3, human

TSL 4

Gene TRAF3IP3, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	HSPA6	P17066	643 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GJA5	P36382	358 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	NEK4	P51957	841 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GTF2A2	P52657	109 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MTMR2	Q13614	643 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672		Q6ZUG5	572 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MYH6	P13533	1939 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF3IP3-208	ENST00000468672		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672		A0A1W2PRG0	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ST18	O60284	1047 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	LPAR1	Q92633	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	DDAH1	O94760	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CETP	P11597	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	HMGCS2	P54868	508 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	NOG	Q13253	232 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	BRF1	Q92994	677 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672		F5H6K3	240 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	RAD21	O60216	631 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CALM1	P0DP23	149 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CALM2	P0DP24	149 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CALM3	P0DP25	149 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	RCAN1	P53805	252 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	INHBE	P58166	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	KLRC3	Q07444	240 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	NDUFB10	O96000	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	AK2	P54819	239 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	EVC	P57679	992 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CCL15	Q16663	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	RLF	Q13129	1914 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ZBTB43	O43298	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PDHB	P11177	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	VCAM1	P19320	739 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	KIF5B	P33176	963 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	SLC1A4	P43007	532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	MCM2	P49736	904 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	TROAP	Q12815	778 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GRM1	Q13255	1194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF3IP3-208	ENST00000468672	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms